马注（1640—1711年），清朝（1644—1911）初年人，字文炳，号仲修，出生于中国南方的云南省。
他出身于一个小知识分子家庭，受到过系统的文化教育，年轻时曾经参加过政府的科举考试，并获得了最初级的功名——秀才。此后，还担任过一些不大的官职。以后，他辞去这些职务，隐居到小乡村，以教书为生。这期间，他开始专门研究伊斯兰教，学习阿拉伯文、波斯文和伊斯兰教经典。
经过多年的努力，他在宗教研究方面取得了很大的成果，成为当时宗教界很有影响的人物，被人们称为“清代云南第一位穆斯林学者”。他还曾经游历全国各地，不但了解了各地的社会状况，而且认识了很多有名的人士。在他的一生中，曾多次向皇帝写信，请求皇帝阅览他的著作，但都没有成功。
此外，他还积极参与伊斯兰教的宗教内部改革。他批评各种异端思想和派别，制订了新的教规，并借助政府的力量来保证得到执行，在一定程度上，对伊斯兰教义及教规的统一起了作用。
他的主要著作是《清真指南》，其内容包括伊斯兰哲理、历史、天文、地理、教义教规、诗文唱和、身世自赞、教派斗争以及阿拉伯、波斯、中国神话传说等资料文献，在后世有非常大的影响。